Хью Майкл Джекман появился на свет в австралийском Сиднее в октябре 1968 года в семье английских эмигрантов. Глава семейства Кристофер Джекман работал бухгалтером, мать Грейс Уотсон занималась домашним хозяйством и детьми. У Хью есть сёстры Соня и Зои и братья Иен и Ральф.
После рождения младшего сына у Грейс обнаружилась послеродовая депрессия, и мальчик полтора года жил у крёстных родителей. Но и после его возвращения домой проблемы не исчезли. Грейс не смогла прижиться в чужой стране.
Однажды, вернувшись со школьных занятий, Джекман попал в пустой дом — мать уехала в Лондон. Через несколько лет женщина забрала к себе дочерей, а сыновья остались на попечении отца.
С матерью актер наладил отношения только в 2011 году.